1、暗視野顯微鏡檢
暗視野顯微鏡檢查是一種檢查梅毒螺旋體的方法。暗視野，顧名思義即是顯微鏡下沒有明亮的光線，它便于檢查蒼白的螺旋體。這是一種病原體檢查，對早期梅毒的診斷有十分重要的意義。
早期皮膚粘膜損害（一期、二期霉瘡）可查到蒼白螺旋體。一期梅毒蒼白螺旋體多在硬下疳的硬結、潰瘍的分泌物和滲出液中存在，腫大的淋巴結穿刺也可檢出。二期梅毒蒼白螺旋體可在全身血液和組織中檢出，但以皮膚檢出率最高。早期先天性梅毒，可以通過皮膚或粘膜損害處刮片發現梅毒蒼白螺旋體。最近，通過羊膜穿刺術獲得孕婦的羊水，以其作暗視野顯微鏡觀察，對先天性梅毒有診斷價值。
2、梅毒血清學檢測
梅毒血清學檢查對于診斷二期、三期梅毒，以及判定梅毒的發展和痊愈，判斷藥物的療效都有十分重要的意義。梅毒血清學檢查包括非梅毒螺旋體血清學試驗和梅毒螺旋體血清學試驗。前者常用于臨床篩選及判定治療的效果，抽血後1小時即可出結果，費用也低廉。後者主要是用于判定試驗，但是它不能判定治療效果，一旦患有梅毒，這一試驗將終身陽性。
(1)非梅毒螺旋體血清試驗 這類試驗的抗原分為心磷脂、卵磷脂和膽固醇的混懸液，用來檢測抗心磷脂抗體。由于這些試驗具有相同的標準化抗原，所以敏感性相似。常用的有三種：①性病研究實驗室玻片試驗（VDRL）；②血清不加熱的反應素玻片試驗（USR）；③快速血漿反應素環狀卡片試驗（RPR）。可用作臨床篩選，並可作定量，用于療效觀察。
(2)梅毒螺旋體血清試驗 包括有：①熒光螺旋體抗體吸收試驗（FTA-ABS）；②梅毒螺旋體血凝試驗（TPHA）；③梅毒螺旋體制動試驗（TPI）等。這類試驗特異性高，主要用于診斷試驗。
3、梅毒螺旋體IgM抗體檢測
梅毒螺旋體IgM抗體檢測是近年來才有的新的診斷梅毒的方法。IgM抗體是一種免疫球蛋白，用它來診斷梅毒具有敏感性高，能早期診斷，能判定胎兒是否感染梅毒螺旋體等優點。特異性IgM類抗體的產生是感染梅毒和其他細菌或病毒後機體首先出現的體液免疫應答，一般在感染的早期呈陽性，隨著疾病發展而增加，IgG抗體隨後才慢慢上升。經有效治療後IgM抗體消失，IgG抗體則持續存在，TP-IgM陽性的一期梅毒病人經過青霉素治療後，約2～4週TP-IgM消失。二期梅毒TP-IgM陽性病人經過青霉素治療後，2～8個月之內IgM消失。此外，TP-IgM的檢測對診斷新生兒的先天性梅毒意義很大，因為IgM抗體分子較大，其母體IgM抗體不能通過胎盤，如果TP-IgM陽性則表示嬰兒已被感染。
4、分子生物學檢測
近年來分子生物學發展迅速，PCR技術廣泛用于臨床，所謂PCR即多聚酶鏈式反應，即從選擇的材料擴增選擇的螺旋體DNA序列，從而使經選擇的螺旋體DNA拷貝數量增加，能夠便于用特異性探針來進行檢測，以提高診斷率。但是，這種實驗方法，要求有條件絕對好的實驗室和技術一流的技師，而我國目前很少有這樣高水平的實驗室。不然有了污染，你放入的是梅毒螺旋體，經過DNA擴增後出現了大腸桿菌，讓你哭笑不得。一些小診所常常趕時髦，掛個PCR實驗室的牌子，吃喝拉撒在一起，只能是自欺欺人。其實診斷梅毒不一定要作PCR，作一般的抽血化驗即可。
5、腦脊液檢查
晚期梅毒患者，當出現神經症狀，經過驅梅治療無效，應作腦脊液檢查。這一檢查對神經梅毒的診斷、治療及預後的判斷均有幫助。檢查項目應包括：細胞計數、總蛋白測定、VDRL試驗及膠體金試驗。
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