內分泌失調是導致男性不育的重要原因之一，必須給予足夠的重視。目前已經探明與男性不育有關的內分泌疾病主要有：
（1）垂體病變：垂體功能亢進，早期可能有性欲增加、體型改變等表現，繼而發生性欲減退、精液異常、陽萎而不育。垂體功能低下，出現性欲、性交能力減低，睪丸萎縮，以致使睪丸內分泌功能不足，生精上皮發育障礙，精于減少，或為死精子，而致不育。
（2）甲狀腺功能減退症：見于粘液性水腫、呆小病等。
（3）甲狀腺功能亢進症：見于突限性甲狀腺腫等。
以上兩種情況皆可導致生精功能障礙，使精子數量減少，死精子增多，精幹活力下降，同時患者可有性欲低下、陽萎等，而致不育。
（4）糖尿病：I型糖尿病患者，生精上皮發生退行性變，精子數減少，死精子增多，並可有明顯陽萎。Ⅱ型糖尿病症狀較輕，對生育影響較小，且Ⅱ型糖尿病發生于年齡較大的人，因而與生育的關系並不密切。
（5）柯興氏綜合征：系腎上腺皮質激素分泌過多所致，多見于腎上腺腫瘤。患者有性欲減退、陽萎，血漿睪酮水平低下，睪丸組織萎縮，間質細胞退化，精子生成障礙。
（6）女性化腎上腺皮質腫瘤：此類腫瘤可分泌大量雌激素，使男性患者女性化，睪丸組織萎縮，精子生成障礙，睪酮分泌受抑制，以致不育。
