一、腦血管疾病:
1、動靜脈畸形（包括隱性者）
2、腦轉移瘤
3、海綿狀血管瘤
二、腦部腫瘤：
1、各種良性腫瘤：
如聽神經瘤、腦膜瘤、顱咽管瘤、三叉神經瘤、鬆果體瘤、脊索瘤、垂體瘤、腦轉移瘤、血管網狀細胞瘤和鼻咽癌等。
2、膠質瘤等惡性腫瘤，
3、顱內腫瘤總體的適應症：
a）腫瘤最大直徑<3.0cm，中線結構無移位及顱高壓症狀尚不明顯者；
b）鞍區腫瘤沒有視神經受壓現象者；
c）腦幹腫瘤在腦幹中體積不超過1/4者；
d）轉移瘤瘤體數不超過3個月，且無嚴重顱高壓症狀者；
e）顱內腫瘤術後復發，或首發腫瘤因病人高齡、體質虛弱，難以承受手術風險者。
4、功能性疾病
a）頑固性疼痛
b）三叉神經痛，強迫焦慮症的有效率達85%以上。
c）帕金森氏病的總有效率為75%。以早期單側病變明顯者療效較好，國內治療的病例數較多。
d）原發性癲癇近期有效率達80%以上。
e）繼發性癲癇（包括外傷性癲癇）治療效果較為理想。
f)精神病等
三、腦血管畸形可用伽瑪刀治療種類：
1、並發頭痛
2、癲癇及無症狀的腦動脈畸形
3、AVM血管巢直徑小于2.5cm
四、顱內良性腫瘤可用伽瑪刀治療種類：
1、聽神經瘤
2、腦膜瘤
3、垂體腺瘤
4、實質性顱咽管瘤
五、顱內惡性腫瘤可用伽瑪刀治療種類：
1、低度惡性膠質瘤
2、體積較小的低度惡性膠質瘤，高度惡習性膠質瘤
3、腦轉移瘤
六、功能性神經外科疾患可用伽瑪刀治療
七、頑固性疼痛
八、頑固性精神病：嚴重的焦慮症與強迫症
九、帕金森氏病：療效顯著
十、三叉神經痛：原發和繼發性三叉神經痛（治療三叉神經痛優點：無創傷、術後無不良反應、無並發症、無死亡等。）
十一、癲癇
